大蒜素胶囊主要的有效成分是大蒜素，主要具有抗菌作用，对多种球菌、百日咳杆菌、白喉杆菌、痢疾杆菌、伤寒及副伤寒杆菌、大肠杆菌、结核杆菌都具有一定抑制和杀菌作用。对真菌感染也具有一定抑制作用，以及对阿米巴原虫、阴道滴虫、蛲虫也具有一定抑制和杀灭的作用。
在临床上主要可以用于真菌感染和细菌感染，比如可以用于肺部以及消化道霉菌感染，用于白色念珠菌菌血症、急慢性菌痢、急慢性肠炎和百日咳等。
大蒜素胶囊使用的时候需要注意，由于大蒜对胃有一定刺激，而且易被胃液破坏，服用的时候不能够咬破，应该整粒吞服。总之，大蒜素胶囊主要具有抗菌作用，可以用于感染性疾病。