肾结石和肾结核是存在明显的区别，主要表现在以下几个方面：
第一、疾病的本质不同，肾结石的患者主要是结石位于肾脏的肾盏、肾盂；而肾结核是由于结核杆菌的感染造成的。
第二、患者的症状不同，肾结石的患者可以出现腰腹部疼痛、发热、恶心、呕吐等；肾结核的患者则主要是全身性的结核感染症状，比如乏力、盗汗等。
第三、影像学检查结果不同，通过彩超、CT可以发现结石的影像属于肾结石；不能够发现结石的影像，通过影像学检查能够发现肾实质的破坏，则有可能是结核。
第四、治疗方式不同，肾结石的患者主要通过自行排石、体外冲击波碎石、手术等处理结石；而结核的患者，则需要进行全身性的抗结核治疗，必要的时候进行外科治疗肾结核引起的肾脏破坏。