目前针对乙肝抗病毒治疗的药物，最好的是干扰素、恩替卡韦、替诺福韦。其中替诺福韦有两种，一种是富马酸替诺福韦二吡呋酯片，另一种是富马酸丙酚替诺福韦片。以上药物均有对乙型肝炎病毒的抑制作用，可以降低乙型肝炎病毒载量，从而减少肝硬化和肝癌的发生率。
干扰素的优势在于不但可以抑制乙型肝炎病毒复制，还可以增加血清转换率。恩替卡韦和替诺福韦的降病毒优势比较大，但是血清转换率相对要低。干扰素应用时有一定的副作用，如流感样症状、发热和骨髓抑制等副作用，替诺福韦有时有肾毒性。