扁桃体结石是应该在耳鼻喉科就诊的。扁桃体结石的原因，主要是因为食物残渣积留在扁桃体隐窝，以及混合有扁桃体隐窝的分泌物和细菌，随着水分的蒸发、钙盐的沉着，就会在隐窝内形成扁桃体结石。扁桃体结石如果没有明显的症状，可以不治疗，如果引起口臭或者是异物感，也可以到耳鼻喉科就诊挑出结石。反复发作就需要做患侧的扁桃体的切除，只有切除扁桃体，才能够防止扁桃体结石的反复的发生。