咽喉囊肿的病人有少部分因为囊肿的皮比较薄，在进食的过程当中使囊肿的皮破裂，囊肿里的内容物可能就会流出，使囊肿减小。多数的这种情况，因为囊肿本身的包皮还在，所以分泌物可能还会逐渐的储积使囊肿再一次长大。
咽喉囊肿如果很小可以观察，病人没有症状通常观察三个月或半年，如果囊肿比较大，比如影响了进食或者是病人有异物感，这种情况通常需要手术治疗。目前的手术也是微创的，通常会经口来进行手术，一般不会在颈部切口，所以如果有咽喉囊肿建议还是到医院就诊，根据情况再进行治疗。