植物神经功能紊乱后，患者可以服用调节植物神经功能的药物，常用的有谷维素、维生素B1等。同时可以应用对症治疗的药物，心慌、胸闷，可以小剂量服用心得安片。胃肠功能紊乱，可以服用多酶片和胃蛋白酶片。失眠患者可以睡前服用地西泮片、艾司唑仑片或者思诺思片。
伴有焦虑抑郁症患者，可以服用抗焦虑抑郁药物，比如氟哌噻吨美利曲辛片、盐酸帕罗西汀片等等。同时，需要寻找引起植物神经功能紊乱的病因，比如帕金森病、更年期综合征、内分泌疾病、甲状腺功能亢进等等。
针对原发病还要进行积极的治疗，患者同时应用心理疏导，调整自我身心，放松精神，保持乐观，提高自己的心理应激能力。