薏米仁性味甘、淡，微寒，入脾、胃、肺经，具有健脾止泻的功效，可以治疗水肿、小便不利、脚气浮肿，常与茯苓、滑石、猪苓等药物配伍使用。薏米可以治疗渗湿止泻、治疗脾虚泄泻，常与白术、山药、党参等药物配合使用。
薏米仁具有祛湿除痹的功效，可治疗风湿痹痛、筋脉拘挛，常与苍术、桂枝、当归等药物配合使用。治疗风湿热痹，可与栀子、防己等药物配合使用。治疗暑湿初起和暑温夹湿之周身酸痛，常与杏仁、白豆蔻等药物配合使用。薏米还具有清热排脓的功效，治疗肺痈，薏米仁还有治疗扁平疣的功效。