首先需要判断甲沟炎属于哪一类型，如果是细菌感染引起的甲沟炎，可以使用抗生素进行治疗。此时可以使用夫西地酸乳膏或者莫匹罗星软膏外涂，也可以使用红霉素乳膏。如果化脓比较明显，也可以使用龙珠软膏进行清热解毒、排脓。
如果是真菌感染引起的甲沟炎，主要可表现为甲沟或者甲周弥漫性红肿。这时需要使用抗真菌药膏，通常可以使用盐酸特比萘芬乳膏、硝酸咪康唑乳膏，以及克霉唑软膏等。还有一些其它原因导致的甲沟炎，比如因变态反应性炎症形成的甲沟炎，一般需要进行抗过敏治疗。