上腹部疼痛是十二指肠溃疡的主要症状，疼痛的部位多位于上腹中部偏右或偏左，十二指肠后壁的溃疡，特别是穿透性溃疡的疼痛可放射至背部；疼痛一般比较轻而能忍受，可表现为隐痛、钝痛、胀痛、烧灼样痛和饥饿样痛；节律性疼痛是十二指肠溃疡的特征之一，与进食有关，疼痛常在两餐之间或餐前发生，进食或服用抗酸剂后可以明显缓解。周期性疼痛是十二指肠溃疡的又一特征，上腹部疼痛可持续数天、数周或数月之后，而有较长时间的缓解，继而复发。在季节上，以秋末至春初较冷的时间更为常见。除疼痛外，还可以有反酸、嗳气、烧心、上腹饱胀、恶心呕吐、食欲减退等消化不良症状，但症状均缺乏特异性。