小儿支原体肺炎，它的自然病程大概是几天到2-4周不等。经合理的抗感染治疗后，一般在1-2周内患者能够痊愈。但是它的恢复期需要1-2周，胸部的X线阴影完全消失要比症状消退延长2-3周。并且要注意，小儿痊愈后，体内会有带菌的情况，一般带菌时间在半个月至4个半月不等，平均为1个半月。因此，在临床中偶尔可见小儿复发的情况。