巴戟天是常用的补阳药物，性味辛、甘微温，入肾、肝经，具有补肾阳、强筋骨、祛风湿的功效。临床中常用于肾虚阳痿、遗精早泄、腰膝酸软、尿频遗尿等症。
对于阳痿、遗精、尿频，常与肉苁蓉、菟丝子、覆盆子等药物配伍使用。对于腰膝酸软或疼痛，常于杜仲、续断等药物配伍使用。巴戟天还用于肝肾不足、筋骨痿软、行步艰难或久患风湿而肝肾虚损，常与肉苁蓉、杜仲、萆薢等配伍使用。对于风湿病，常与枸杞、淫羊藿、当归等药物配伍使用。