禽流感依据感染的不同亚型，临床表现是有差异的，轻症患者可能仅仅是轻微的上呼吸道症状，也可以表现为结膜炎的症状。重症患者一般起病比较急，早期的表现类似于普通型的流感，表现为发热，体温大多维持在39度以上，一般会有1-7天的发热期，多数病人是3-4天，可以伴有流涕、鼻塞、咳嗽、咽痛、头痛、肌肉酸痛和全身的不适，在发病1-5天之后，会出现呼吸急促以及明显的肺炎表现。有一部分重症的患者病情发展是非常迅速的，在发病1周之内就会出现呼吸困难，然后发生呼吸衰竭，还可以出现肺炎、肺出血、胸腔积液、全血细胞减少、肾衰竭、败血症、感染性休克等多种并发症。