肛周脓肿手术最常见的并发症是肛瘘的形成，主要是由于肛窦的反复炎症感染形成的，急性期应该及时的进行手术治疗，并且在手术以后应该及时的进行换药，每次排便之后都应该进行清洗、坐浴，预防创面感染。根据脓的细菌培养结果，针对性的应用抗感染药物。也要注意合理的膳食，增加饮食营养，多吃高蛋白的食物，促进创面的愈合。感染的创面很容易出现瘢痕的增生，病人最后会遗留局部的瘙痒或者疼痛，可以适当的应用痔疮膏剂缓解症状，平时应该积极的治疗便秘这些疾病，适当的进行体育运动锻炼，增强体质。