吃辣椒之后拉肚子腹泻，其实是一种正常的人体生理反应。辣椒里是富含辣椒素的，辣椒素会刺激肠道细胞，从而会导致胃肠道运动功能的紊乱，这可能是引起腹泻的最主要的原因。
结肠细胞存在着辣椒素的受体，结肠细胞的辣椒素受体，在吃完辣椒之后就会被激活，引起肠道运动的紊乱。结肠本身的作用是把没有成形的粪便缓慢的推到肛门，从而排出体外，并在这个过程当中吸收水分使大便成形。
吃辣椒之后，结肠上的辣椒素受体就会被过度的激活，会使得结肠的运动变得非常的快，导致肠管没有足够的时间来吸收粪便中的水质，从而导致粪便不成形，自然那就会出现稀便，也就是常说的拉肚子。