咽喉部与耳深部的发痒，往往考虑是过敏引起可能。如果是过敏引起，患者是过敏的体质，并常伴有其他部位的过敏性疾病，如过敏性鼻炎、过敏性咽炎或者有皮肤湿疹、皮肤荨麻疹等发病史。
如果有在外面不洁掏耳史，考虑真菌性外耳道炎可能，也会出现外耳道深部发痒，并且有外耳道耵聍异常增多。
如果家里有养狗、猫等宠物，有可能会出现少见的耳痒螨病等，引起耳朵深部发痒的感觉。如果上呼吸道感染早期，也可能会出现咽喉部与耳朵深部交界位置，发痒等症状。