如果检查发现有右侧卵巢囊肿，要看囊肿的体积大小，如果囊肿体积小于5cm并且回声比较好，多见于是生理性的囊肿，比如黄体囊肿，这是在排卵以后形成黄体萎缩出现的血肿，这种情况在月经干净以后往往就会自然消失，一般没有必要特殊治疗，但是如果黄体囊肿发生破裂造成内出血，需要紧急处理。
如果附件区囊肿体积比较大并且回声不好，考虑是病理性的囊肿，出现病理性囊肿的原因比较多，常见的有畸胎瘤，还可能有巧克力囊肿，畸胎瘤是先天性的原因，巧克力囊肿发生的原因和子宫内膜异位症有关系。这种情况建议进一步检查肿瘤标志物，如果药物治疗效果不好，需要手术切除囊肿治疗才可以。