急性细菌性心内膜炎一定要及早治疗，可以提高治愈率，应该选用抗生素治疗，在应用抗生素治疗前应抽取足够的血培养。根据病情的轻重，推迟抗生素治疗几个小时乃至1-2天，并不影响本病的治愈率和预后。明确病原体，采取有效的抗生素是治愈本病最根本的因素。一般选用大剂量的青霉素、链霉素、头孢菌素类等杀菌剂，并维持血中有效的杀菌浓度，它们能穿透血小板纤维素的赘生物基质，杀灭深埋在赘生物中为纤维蛋白和血栓等掩盖的细菌，达到根治瓣膜的感染，减少复发的危险。如果药物治疗无效，就要选择外科手术治疗。凡出现进行性瓣膜功能减退或不易纠正的心衰，持续的脓毒血症以及敖生物栓塞都是手术的指征。