泌尿系统结石可以分为肾脏结石、输尿管结石和膀胱结石等，不同位置的结石造成的临床症状也不一样。一般对于肾脏结石，如果结石较小，通常没有任何临床症状。当肾脏结石引起肾积水的情况下会发生腰部酸胀、疼痛的感觉。
通常疼痛的性质属于胀痛，并不特别明显。而输尿管结石的典型临床表现是肾绞痛，疼痛发作比较明显，剧烈，患者难以忍受，常常大汗淋漓，大喊大叫。对于膀胱结石，常见的临床表现是排尿时出现排尿中断的现象。
主要的原因是由于排尿时膀胱结石堵塞尿道内口，造成膀胱出口梗阻，从而引起排尿不出的症状。