多发性硬化最主要的检查方法是核磁检查，包括头颅核磁和颈椎的核磁。头颅核磁可以显示病灶在侧脑室旁边、小脑脑干或者近皮层的部位。另外颈椎核磁也可以显示颈椎的病灶，胸椎核磁可以显示胸椎的病灶。核磁是多发性硬化最重要的一个辅助检查，除了核磁多发性硬化，还要进行腰穿检查，也就是脑脊液检查。除了常规生化，还要包括寡克隆带和IgG24小时合成率，这些的异常可以提示多发性硬化是一个免疫的异常。此外还可以做一些诱发电位的检查或者血液常规的检查，包括生化免疫系统的免疫相关的检查，这些可以排除其他一些疾病。