脂肪瘤手术的麻醉方式一般是局部麻醉。术前准备一般清洗好局部的皮肤，有毛发的地方要把毛发刮除掉。手术步骤一般是沿着脂肪瘤表面其长轴与皮纹一致的方向做切口，可以保持手术切口的美观。
手术切除的时候要直达脂肪瘤的包膜，沿着脂肪瘤的包膜，用食指或者止血钳进行钝性分离，直至剥除后彻底结扎止血，缝合残腔，要将创底带入，不要留死腔，然后缝合皮下和皮肤。
另外一种就是挤压法，对于四肢和其它皮肤组织比较疏松的小的脂肪瘤，与周围组织无慢性炎症粘连的地方可以用该法。
先以左手的拇指、食指、中指捏起肿瘤，全层切开肿瘤表面的皮肤，用力均匀的挤捏，肿瘤即可划出皮肤切口，再切除，并且逐层缝合皮下组织和皮肤。脂肪瘤切除以后的手术并发症一般有血肿、感染和瘢痕。