感染性心内膜炎诊断主要是依据患者的临床表现以及辅助检查。在临床表现上，患者往往会有不同程度的发热，热型不规则，热程比较长。
另外，患者有可能伴有盗汗、食欲减退、体重下降、关节疼痛、皮肤苍白等表现。心脏方面的体征，一般情况下患者会出现心脏杂音，主要是心脏瓣膜的赘生物导致的，往往杂音比较响亮。
患者会有充血性心衰的表现，出现心音低钝、奔马律，有可能会导致栓塞的症状。还有患者会出现腹痛、血尿，甚至有可能出现肺栓塞、脑栓塞。
对于感染性心内膜炎的检查主要是做血培养，如果血培养能够发现细菌，这种情况就可以确诊感染性心内膜炎。通过心脏彩超检查发现瓣膜问题，而且发现有赘生物。