红斑狼疮的临床表现复杂多样，侵犯多个器官，大多数患者呈缓解与发作交替的过程。约80%的患者皮肤与黏膜，可以出现皮肤损害。患者面部可以有蝶形红斑，也可以是盘状红斑。约有60%的患者，有局限性或广泛性的斑丘疹，伴有痛痒感，多见于日晒部位，有时会出现水疱、大疱和血疱等，大疱破溃后可以形成糜烂和溃疡。少数患者可以有口腔黏膜的点状出血、糜烂、溃疡或者雷诺现象、脱发等。在活动期还可以出现发热、关节痛。肾脏损害以慢性肾炎和肾病综合征较常见。心血管系统损害以心包炎最常见。呼吸系统可以伴有胸膜炎、间质性肺炎、胸腔积液等。其他还可以出现精神异常、血液学的变化等。