牙周炎很难根治，如果得了急性的牙周炎，可以口服头孢类的抗生素和甲硝唑类的药物。如果头孢类的药物过敏的话，可以改用红霉素类的药物，也可以口服洁霉素、克林霉素或者是螺旋霉素。
如果是慢性的牙周炎，也就是牙周病，不需要进行全身药物治疗。不管是急性牙周炎还是牙周病，重要的治疗主要是靠局部治疗，而不是全身药物治疗。
可以到正规医院的口腔科，或者大型医院的牙周病科进行牙周治疗，在急性期需要用双氧水、盐水反复的冲洗牙周袋，将牙周袋内的食物残渣、软垢、牙菌斑、游离细菌都冲洗出来，然后再外用碘甘油控制急性炎症，急性炎症控制以后进行洁治、刮治、根面平整，有的需要配合调整咬合。