糠秕孢子菌可以根除，但是需要系统足量的治疗。可以口服伊曲康唑胶囊1天1次，1次2粒，通常情况下口服时间不少于1个月。并且可以配合外用抗真菌的药膏如盐酸特比萘芬软膏，或者萘替芬酮康唑乳膏。还可以应用盐酸阿莫罗芬搽剂，1天2次外擦患处。并且在治疗的同时还可以口服百癣夏塔热胶囊，起到清热解毒、祛癣止痒的效果。还可以应用中药的治疗办法，主要的组成成分是土槿皮、土大黄、百部煎水湿敷或者外洗患处，起到杀灭真菌的效果。并且还应该在治疗期间避免饮酒，避免食用辛辣刺激性食物。