有部分肺结核患者，如出现咳嗽、痰多，导致吞咽带有结核菌的唾液，可以使结核菌进入肠道，会引起肠结核。另外，如输卵管结核、结核性腹膜炎等，都可以使结核病菌蔓延至肠部，导致肠结核。含有结核杆菌的肠内容物可以在回盲部停留时间比较长，就会增加局部黏膜的感染机会，从而也可以导致肠结核。
肠结核的患者会出现腹痛、腹部包块、排便习惯改变，以及结核性中毒症状。总之，肠结核是结核杆菌侵犯了肠道引起的疾病，多发生于40岁以下的青壮年，一般预后良好，不影响寿命。