白细胞减少症引起的原因是多种多样的，故治疗方法也多种多样，总结起来有以下五种治疗原则：第一个去除病因、停用可疑的药物、去除其他的致病因素。第二个是感染的防治，轻度减少者一般不需特殊的处理方法，中度、重度应该及早的进行抗感染的治疗。粒细胞缺乏伴发热应经验性应用覆盖革兰阴性菌和革兰阳性菌的广谱抗生素，同时进行病菌源学的检查，以明确感染的类型和部位。第三个是促进中性粒细胞生成，使用细胞因子。第四个是免疫抑制剂，自身免疫性中性粒细胞减少和免疫相关的中性粒细胞减少，可用糖皮质激素等免疫抑制剂。第五个是造血干细胞的移植，这个适用于先天性中性粒细胞减少。