小便时下腹部疼痛，可能的原因和疾病如下：1、膀胱结石或者输尿管下段结石，结石刺激局部黏膜可产生黏膜损伤、出血和局部疼痛感，尤其是排尿时结石梗阻于尿道，可产生排尿中断，伴尿道内疼痛。建议进一步行泌尿系统B超检查，确定是否存在泌尿系结石。2、泌尿系统感染，发生感染后泌尿系统黏膜上皮充血、水肿、膀胱敏感性增高，并且伴有膀胱黏膜局部损伤，可出现小腹部坠胀疼痛、排尿疼痛或者肉眼血尿、腰痛、发热等症状，需要行尿液常规和尿培养检查进一步确诊。3、泌尿系统肿瘤，如膀胱肿瘤或者输尿管下段的肿瘤等，都会出现排尿疼痛，早期不明显，体积增大侵犯膀胱壁或者周围盆壁组织时疼痛可逐渐加重，同时，可伴有肉眼血尿，需要进一步行泌尿系统B超或者CT检查确诊。