上尿路结石比如肾结石、输尿管结石，有的时候会引起腰部、上腹部剧烈疼痛的症状。疼痛的原因主要是由于肾结石堵塞在肾脏出口，或者输尿管结石嵌顿在输尿管的狭窄处，引起上尿路急性梗阻，使肾盂和输尿管管腔内的压力突然增高，管壁局部扩张、痉挛和缺血，就会引起疼痛的症状。
疼痛的程度与结石所在尿路的位置、大小、活动与否、有无损伤和感染等因素有关，如果肾结石、输尿管结石造成上尿路慢性梗阻，由于疾病发展缓慢，结石引起的疼痛症状大多不明显，表现为腰部的酸胀、钝痛，有的甚至没有任何临床症状，而这种情况容易被忽视，结石会对肾功能造成不可逆的损害。