钛网颅骨修补手术的操作方式大同小异，但是和钛网的材料不同，操作方式略有不同。
如果患者手术前做了三维CT，所用的颅骨钛网已经是三维塑形的，在手术当中手术医生不需要再二次塑形，直接沿着以前的手术切口切开头皮，暴露颅骨缺损，然后在相应的颅骨边缘固定颅骨钛网。固定妥当以后，再依次缝合头皮、肌肉，整个手术就完成了。
如果患者所使用的钛网，没有经过预塑形，手术医生在手术当中，还要根据对侧颅骨的情况进行人工塑形。人工塑形满意以后，才能安装到患者的颅骨，手术时间大概会延长半个小时。