慢性肾炎的预后受到许多因素的影响。影响慢性肾炎预后的因素有病理因素，包括病理类型，比如轻度系膜增生性肾炎的预后就良好，重症的系膜增生性肾炎及膜增生性肾炎、局灶节段性肾小球硬化的预后相对较差，膜性肾病预后较好，进展相对缓慢。此外还有慢性化指标，如纤维性新月体的数量、肾小球硬化的数目、间质纤维化的程度以及肾小管萎缩的多少，都与预后相关。上述指标越多，则预后越差。肾内血管疾病病变严重者，预后较差。临床表现有持续性存在的大量蛋白尿和持续性血尿者，肾功能恶化相对的较快，血压高且无法控制者以及肾功能减退者，预后相对较差。肾小管间质损害的征象，如肾性贫血、夜尿增多、肾小管酸中毒等明显者，预后相对较差。此外，高蛋白饮食也可加速慢性肾炎病情的发展。