乙肝小三阳出现病毒的复制要进行肝功能的检查，如果肝功能完全正常，说明仍然是健康携带者，没有肝炎发作，不需要任何治疗。
但如果乙肝小三阳出现病毒复制的同时伴有肝功能的损害，表现为胆红素的升高、转氨酶的升高就需要进行口服抗病毒药物治疗，推荐的抗病毒药物包括恩替卡韦及替诺福韦，能够有效抑制乙肝病毒的复制，延缓肝纤维化、肝硬化的发展并且降低肝癌的发生概率。乙肝小三阳携带者最重要的是每半年定期进行肝病体检，如果在定期的体检当中并没有发现肝炎的发作，就属于健康的携带者，健康携带者即使有病毒的复制也不需要进行抗病毒治疗。