生殖系统感染后，首先要明确病因及感染菌，然后根据体格检查和实验室检查来制定相应治疗方。建议就医后先行查体，明确感染部位是位于包皮、龟头、阴茎、阴囊或睾丸等部位；其次要明确有无伴随症状，如尿道口流出脓性分泌物，龟头伴有脓性分泌物或疼痛、发热等症状；最后要做一系列的化验检查，比如留取尿液常规做检查，如有分泌物，应留取分泌物涂片或培养检查；必要时需要行B超、CT等检查，明确脏器内部有无实质性病变，如睾丸体积增大、附睾增粗、阴囊内鞘膜积液等。最终根据检查结果，请专科医生来治疗专业的治疗方案，比如抗感染治疗、抗病毒治疗、外用药物治疗或手术治疗等。