肾囊肿分为先天性肾囊肿及后天性肾囊肿。先天性肾囊肿属于一种遗传性疾病，可发生于儿童，也可发生于成人。
其发病原因为基因突变造成，所以治疗较为困难，仅能针对后期出现的肾积水、肾衰竭对症处理，或减压，或透析治疗。如后天性囊肿，称为获得性囊肿，一般无临床症状。但随着囊肿的生长，可以造成肾或周围组织的压迫，产生疼痛或血尿等症状。如果囊肿较小，如小于4cm，则建议观察，无需特殊处理。
但如果囊肿在4cm之内，但伴有腰痛、血尿的病史，则建议行B超引导下穿刺引流。如果囊肿体积大于4cm，甚至10-20cm以上者，则会对肾组织及周围组织造成压迫、或产生疼痛的症状，建议住院行微创手术治疗。