不同的白塞氏病的患者，预后是不同的，多数患者病情长期处于缓解、复发交替的状态，也有部分患者经过有效的治疗后能够达到痊愈。仅表现为口腔溃疡或皮疹的患者，预后是比较好的。表现为系统受累的患者，如眼部神经系统和肠道受累，不治疗则预后不好，严重者导致失明、肠穿孔或者死亡，所以需积极的治疗，并且治疗越早，效果越好。白塞氏病在治疗上主要是以药物治疗为主，需要服用药物的时间长短也不一，多数患者需要较长时间的服药，主要是免疫调节药和免疫抑制药，还包括外用药、口服激素等等。