腘窝囊肿不治疗的危害主要包括两点，其中之一就是腘窝囊肿不断增大，从而可以影响到膝关节的伸屈活动，尤其是可以明显的影响到膝关节屈曲活动。另外，也可以造成对周围重要的血管、神经压迫，从而引起下肢缺血症状，或者是感觉运动异常。如压迫到腘动静脉或者是胫神经等，都可以造成下肢的血供障碍，或者是下肢的踝关节，或者小腿和足部的感觉运动障碍等。但是，对于较小的腘窝囊肿，其实也是不用手术治疗的，注意密切观察就行。对于较大的，如果产生了以上的临床症状，建议及时采取手术切除的治疗方式，进行彻底治疗。