精子畸形率为97%，说明患者为畸形精子症，这种情况下，虽然不能说完全不能够使配偶怀孕，但是怀孕的几率以及怀孕的质量都是明显下降的。
出现畸形精子症的原因是比较多的，通过精液常规检查，或者精子运动轨迹分析是可以明确诊断。
常见的原因包括激素水平的缺乏、泌尿生殖系统存在相关疾病、精浆生化成分异常、染色体分型异常等等，只有诊断明确了，才能够进行针对性的治疗。
一方面，可以应用中成药物，如五子衍宗丸、麒麟丸等等，来提高精子的质量，另一方面，根据不同的病因进行针对性的处理。