备孕男方的主要检查有：1、精液检查。精液检查主要包括精液常规、精子形态正常指数、精子顶体形态指数、精子顶体酶测定、精子核蛋白组型转换测定、精子DNA碎片指数。2、血液检查主要包括叶酸、同型半胱氨酸和优生十项。3、感染因素检查，主要有支原体、衣原体、淋球菌、梅毒、艾滋病等检查。女方的检查主要包括基础性激素检查、甲状腺素的检查、血糖的测定和彩超的检查，妇科彩超主要包括子宫、输卵管的检查，还有一些感染因素的检查，主要有支原体、衣原体、淋球菌、梅毒、艾滋病和阴道分泌物五联检等检查。