大多数隐性脊柱裂的患者并没有明显的症状，也不会出现如显性脊柱裂那样的后背部的包块，也有一小部分的患者会出现排尿功能障碍，有的时候会出现长期的尿失禁，特别是夜间的遗尿，偶尔也会出现一些神经功能的其他的症状，如腰骶部神经支配区的感觉功能障碍，这种情况是相对比较少见的，更多的患者是因为各种原因进行神经影像学检查的时候意外发现的隐性脊柱裂。