胚胎停止发育有很多原因，最常见的原因有几下几种：男女双方染色体的异常，或胚胎本身发生基因突变。女性内分泌失调，女性子宫发育异常，不利于胚胎着床。女方有感染性的因素，如支原体、衣原体感染或者病毒感染。免疫功能或者凝血机制有异常。以上这些因素，都会引起胚胎停止发育。有约50%的人，是查不到原因的。所以，如果连续发生2次胚胎停止发育，一定要进行系统的检查。