男性不育症的主要病因有：一、医源性因素，如手术、药物；二、全身性因素、环境因素，如慢性肝、肾功能衰竭、环境污染、雾霾；三、先天性因素，如尿道上、下裂，隐睾；四、获得性因素，如泌尿生殖道的手术；五、精索静脉曲张；六、感染性因素，如急慢性附睾睾丸炎、结核性附睾睾丸炎、输精管炎；七、内分泌性，如低睾酮血症合并高促性腺激素血症和高泌乳素血症。如果没有这七种病因，又可以叫特发性男性不育症。