皮脂腺囊肿的手术费用，根据不同医院和不同地区的收费情况，存在着一定的差异。另外，体表的皮脂腺囊肿由于可以在局部麻醉下进行手术切除，手术费用相对比较低，一般在1000左右可以解决问题。如果是深部组织，胸腔、腹腔或盆腔里面的皮脂腺囊肿，这种情况下手术难度比较大，需要在全身麻醉情况下进行手术，这时费用相对比较高，有的甚至可以高达万元以上。