对于脑外伤之后引起的癫痫，在治疗上首先应该考虑的是尽可能的去除引起癫痫的病因，这样才能有效改善患者的预后。比如对于颅脑火器伤和开放性损伤造成的癫痫，早期清创和有效的处理伤口是十分重要的，这样能够预防癫痫的发生。
如果第一期没有有效的处理伤口，之后引起癫痫，还要考虑进行二次清创去除异物和处理瘢痕，这样能够有效的控制癫痫的发生。另外，对于一般性的颅脑损伤的患者，早期发生癫痫应该着重寻找病因，比如因为颅骨凹陷骨折造成的癫痫，应该及时整复，去除凹陷性的骨折碎片。
同时，还需要重点探查和清除颅内血肿、挫伤的脑组织，同时积极控制脑水肿和颅内感染，这样能够使癫痫从病因上得到有效的处理和控制。
如果外伤之后的癫痫，经过正规的药物治疗，2-3年仍然不能有效控制发作，或者一些耐药性、难治性的癫痫，可以考虑进行手术治疗。在手术治疗之前，需要进行完整系统的神经影像学检查和脑电图等评估，通过这些评估综合考虑，对癫痫病灶进行有效的处理。
但是，绝大多数脑外伤之后的癫痫，通过药物治疗都能得到很好的控制。常用的药物有丙戊酸钠、左乙拉西坦以及卡马西平等药物，需要根据患者临床发作的类型选择合理的用药。