益生菌是一种对人类有益的活性微生物，主要定居于肠道、生殖道。这种细菌在肠道本身就有，但因为抗生素的使用或者外来细菌的入侵，导致肠道菌群失调，需要益生菌来辅助调节。
益生菌也有辅助消化的作用，在临床上常用的肠道益生菌有整肠生、金双歧、思连康、培菲康等。当病人有腹泻、便秘和胃肠功能紊乱时，需要使用肠道益生菌来调理，疗程一般在两周左右。
使用益生菌时不能跟广谱的抗生素同时使用，这是因为广谱的抗生素对肠道益生菌有杀灭作用，会影响到益生菌的效果。建议跟这类药物同时使用时，需要间隔两小时以上。