膀胱癌手术以后，化疗常用的给药方法有膀胱灌注化疗和静脉全身化疗两大类。膀胱灌注化疗应用在非肌层浸润性的膀胱癌，通常是配合膀胱肿瘤电切术来进行。手术以后进行即刻灌注，而后进行持续加强灌注，使用的化疗药有吡柔比星、丝裂霉素、吉西他滨、表柔比星、羟喜树碱等，药物经过融化以后通过导尿管灌入到膀胱当中，而后保持30分钟左右，随尿液排出即可。没有全身化疗的副作用，但是局部可能会有刺激性。
全身静脉化疗常应用在手术前、手术后或者单独应用，多数用于治疗中晚期膀胱癌，常用的化疗方案包括MVAC、GC等，是由医生根据患者的具体情况来制定的方案。静脉化疗有可能出现恶心、呕吐、头发脱落，及白细胞减少等副作用。