婴儿腹泻的治疗包括饮食疗法、药物治疗以及并发症的治疗。通常情况下，药物治疗包括以下几个方面：控制感染，水样便腹泻的患者多为病毒及非侵袭性细菌所致，一般不使用抗生素，应该合理使用液体疗法，选用微生态制剂和黏膜保护剂。如果是黏液脓血便患者多为侵袭性细菌感染，应该根据大便常规和血常规，具体选择适当的抗生素进行治疗。微生态疗法，有助于恢复肠道正常菌群的生态平衡，抑制病原菌定植和侵袭，控制腹泻，常用的有双歧杆菌等。肠黏膜保护剂，能够吸附病原体和毒素，维持肠细胞的吸收和分泌功能，常用的有蒙脱石散。