儿童扁桃体发炎时，对药物的选择通常根据致病原判断，需要做血常规、C-反应蛋白、支原体等相关的检查作为支持。如果是病毒感染，没有特效的抗病毒药物，只需要对症治疗即可，例如咽部疼痛明显，可以给宝宝使用开喉剑喷雾或者碘甘油做口腔护理，缓解局部炎症。如果证实有明显的细菌感染，这时需要使用青霉素或者头孢霉素，青霉素通常会选择阿莫西林或者阿莫西林克拉维酸钾等；头孢类抗生素通常可以选择头孢克洛、头孢泊肟等。如果扁桃体发炎是支原体感染导致，需要使用大环内酯类的抗生素，例如依托红霉素、罗红霉素、阿奇霉素等。除抗感染治疗外，其他方面例如发热，需要使用退热药物进行适当的处理。