良性胃间质瘤长的并不快，生长比较缓慢，主要是由于肿瘤细胞比较稀疏，细胞增殖活性比较低，所以生长比较缓慢。良性的胃间质瘤，可发生于胃肠道的各段，也可以发生于大网膜、肠系膜，其次为小肠、结肠和食管等部位。
良性胃间质瘤为浆膜、黏膜下和胃壁内结节，直径一般比较小，多数为1-2cm，也可以生长、增大至20cm不等，而且呈局限性生长。
绝大多数肿瘤没有完整的包膜，偶尔可以看到假的包膜，当肿瘤体积增大时，会伴有囊性变、出血、坏死等改变。良性的胃间质瘤，一般临床中以手术切除治疗为主，术后密切随诊，定期复查，防止出现恶性的可能性。