舌下囊肿有自愈的可能，如果囊肿非常小，没有任何临床症状，可做临床观察，有自愈的可能性。
但是，若舌下囊肿不断增生增大，最好是手术局部将肿物切除，效果非常好。舌下囊肿主要多见于唇黏膜，其次为颊部、口底、舌部以及腭部粘膜，多数在1cm以下。发生在口底部位的囊肿与舌下腺及颌下腺相关，又称为舌下囊肿或蛤蟆肿。
主要的镜下特点是外渗性黏液囊肿，黏液外溢进入结缔组织中，黏液被炎性肉芽组织或纤维结缔组织包围，无上皮衬里。在临床中，若病变比较小，有自愈的可能。但是病变若大，则需要手术切除治疗，建议患者要密切随诊，定期复查。