小儿急性菌痢是由志贺菌属引起的肠道传染病，所以治疗首先要进行消化道隔离，隔离直到临床症状消失，大便常规连续2次阴性才能解除隔离。如果发热严重时建议卧床休息为主，需要进食容易消化的饮食，婴儿可以继续哺乳，母亲注意饮食，不能吃太油腻的、生冷、刺激的食物，奶粉喂养的宝宝建议换成腹泻奶粉，同时要补充足够的水分，停辅食。年长儿可以吃稀点的米汤、米粥、面条，适当多喝水，水里建议加上口服补液盐。抗生素治疗为主，建议应该根据大便培养和药敏实验的结果在医生的指导下合理用药，也可以先进行经验性的使用抗生素，通常首选头孢或者是青霉素，不建议用喹诺酮类的药物。抗生素需要用到热退以后3-5天，以及大便常规阴性时才能停药，之后也可以建议继续口服一段时间的益生菌进行调理。