腱鞘囊肿的治疗主要看囊肿所在的部位和大小。如果腱鞘囊肿较小，对生活没有明显影响，可以尽量保留，不需要手术治疗，只要严密观察就可以，减少对腱鞘囊肿处的刺激。如果腱鞘囊肿相对较大，已经有明显的影响生活的情况，可以考虑将囊液完全抽净并且注入曲安奈德20mg。
另外也可以选择比较有经验的医生将腱鞘囊肿拍碎，适当的加压包扎，但这种方法并不一定百分之百的消除。最终想要彻底去除还是需要手术治疗，将腱鞘囊肿彻底切除。